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肽鍵是一分子氨基酸的α－羧基和一分子氨基酸的α－氨基脫水縮合形成的酰胺鍵，即-CO-NH-。氨基酸借肽鍵聯(lián)結(jié)成多肽鏈。是蛋白質(zhì)分子中的主要共價鍵，性質(zhì)比較穩(wěn)定。它雖是單鍵，但具有部分雙鍵的性質(zhì)，難以自由旋轉(zhuǎn)而有一定的剛性，因此形成肽鍵平面，則包括連接肽鍵兩端的C═O、N－H和2個C共6個原子的空間位置處在一個相對接近的平面上，而相鄰2個氨基酸的側(cè)鏈R又形成反式構(gòu)型，從而形成肽鍵與肽鏈復(fù)雜的空間結(jié)構(gòu)。